当苹果推出12.9英寸的新iPad Pro时，有报道称，由于厚度增加，新iPad将无法与上一代妙控键盘兼容。苹果后来证实，当与新的iPad Pro搭配使用时，旧的妙控键盘可能无法正常合上。
然而随着新iPad Pro测评的出炉，显示上一代的妙控键盘确实可以与新的12.9英寸iPad Pro完美地配合使用。The Verge的Dieter Bohn说，当他测试的时候，他无法“辨别出原版和新款白色妙控键盘的契合度有什么不同”，而且它工作正常，关闭得也很“好”。
而Engadget的Chris Velazco表示，iPad Pro与旧款妙控键盘配合使用的效果“还不错”，但他指出，“键盘在合上时会压入显示屏的玻璃中，这意味着它的适合性可能会受到屏幕保护膜的影响”，也就是说，新款iPad Pro 与旧款妙控键盘的使用体验“肯定不是很理想”。然而，尽管不是完美适配，Velazco并不认为客户需要再买一个新的。
在对新款12.9英寸iPad Pro的测评中，YouTuber Marque Brownlee还指出，新款iPad与去年的妙控键盘配合“完美”，但合上后可能会感觉有点“贴身”。